案情摘要：

甲公司是铁路线的建设方，但是该项目未获得国土部门出具的压覆矿产资源批准手续。某地质勘察总院享有涉案铁路地区的探矿权，2010年3月甲公司与勘察总院达成会议纪要，约定共同委托某公司对所涉的矿产含量和探矿权价值进行评估。某公司出具了评估报告，评估价值7889.16万元，2010年10月勘查总院与甲公司签订了补偿合同，约定甲公司向勘察总院支付7380元补偿款，约定了支付期限。合同约定甲公司支付补偿款后享有相关地区的探矿权，否则应当停止建设活动。甲公司未履行合同。2011年勘察总院起诉至法院，要求甲公司停止建设，赔偿12000万元（以评估为准）。

判决结果：

一审法院认定甲公司侵害了勘查总院的探矿权，双方已经委托某公司评估并且签订了补偿协议，以7380万元为准，判决甲公司判决生效后支付60%，在勘察总院出具同意压覆书后10日内支付40%。甲公司上诉，二审驳回上诉维持原判。

最高法院民一庭意见：

根据侵权责任法的规定，侵害探矿权的，应承担相应的侵权责任。对侵害探矿权的损害赔偿，应是对探矿权作为一种独立的用益物权价值的赔偿，而不是仅指对探矿实际投入的直接损失的赔偿；对探矿权的财产价值，必要时法院可以委托有资质的专业机构进行评估确定。